I Boxtrolls sono fastidiosi mostriciattoli che vivono nelle fogne del piccolo borgo di Pontecacio e di notte escono per rubare formaggio e rapire bambini... o almeno questa è la leggenda che gli abitanti della cittadina raccontano ai figli. In effetti i Boxtrolls sono degli adorabili e strambi folletti che da anni si prendono cura di Uovo, un ragazzo abbandonato da piccolo. Minacciati da un malvagio disinfestatore, i Boxtrolls affidano la propria sopravvivenza al giovane umano: con l'aiuto di una coraggiosa ragazza Uovo dovrà avventurarsi in superficie per salvare la comunità dei Boxtrolls e l'anima stessa di Pontecacio